Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms