Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hhla1Q3TYV2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hhla1Q3TYV2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms