Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms