Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TTL0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTL0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTL0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTL0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTL0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTL0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3TTL0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3TTL0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTL0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTL0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTL0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTL0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTL0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTL0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTL0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTL0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTL0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTL0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTL0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTL0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTL0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTL0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTL0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms