Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp39Q3TIX9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms