Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kndc1Q0KK55 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms