Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms