Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms