Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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