Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms