Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms