Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms