Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms