Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms