Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms