Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a1Q04857 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col6a1Q04857 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms