Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms