Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddr1Q03146 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms