Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfiaQ02780 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms