Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms