Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms