Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja5Q01231 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms