Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms