Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms