Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Il6stQ00560 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms