Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms