Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms