Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nbr1P97432 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms