Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms