Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf1bP97358 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms