Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms