Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms