Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms