Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms