Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms