Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbdsP70122 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SbdsP70122 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms