Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Crip1P63254 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms