Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms