Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Rps29P62274 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Rps29P62274 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rps29P62274 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms