Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps18P62270 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps18P62270 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps18P62270 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps18P62270 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps18P62270 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms