Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms