Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2iP60898 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms