Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms