Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms