Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms