Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Irf5P56477 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf5P56477 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf5P56477 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf5P56477 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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