Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aqp4P55088 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aqp4P55088 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aqp4P55088 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms