Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NrlP54846 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NrlP54846 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NrlP54846 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrlP54846 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms