Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms