Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfP51642 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CntfP51642 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CntfP51642 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CntfP51642 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfP51642 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfP51642 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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